L'atoll de Fakarava offre de nombreux spots encore peu visités et une richesse faunique éblouissante, tels que « la passe nord ou Garuae » lieu de prédilection de grands bancs de poissons tropicaux en tous genres, mais surtout de nombreux requins Raira, pointes noires et pointes blanches, parfois même de magnifiques marlins voiliers.

Au mois de juillet, il est possible d'assister à un spectacle extraordinaire : le rassemblement de milliers de loches, ces gros mérous parés de leur tenue de camouflage.

Récemment offerte à l'exploration, la passe de Tamakohua à Tetamanu dans le sud de l'atoll, offre une faune d'une richesse époustouflante, que l'on peut très facilement observer grâce à l'étroitesse de la passe.